Conseil en bioinformatique
Un regard expert et indépendant sur vos projets omiques, de la première décision stratégique jusqu'aux résultats finaux. Nous vous aidons à identifier la bonne technologie et la bonne approche analytique, à construire un protocole rigoureux, à éviter les pièges classiques qui compromettent une étude, et à auditer ou compléter des analyses déjà réalisées. Conseil en amont ou analyse opérationnelle : nous nous adaptons à votre situation.
Au forfait ou au taux horaire · échange confidentiel · réponse sous 48 heures
Pourquoi c'est important
Les erreurs les plus coûteuses surviennent avant le premier échantillon séquencé
Un design sous-dimensionné, un effet batch non contrôlé, une technologie inadaptée à la question posée : lorsque ces problèmes se révèlent dans les données, il est le plus souvent trop tard pour les corriger sans tout reséquencer. Les projets omiques n'échouent pas faute d'implication, mais faute de la bonne décision analytique au bon moment. Notre rôle est d'intervenir avant que ces écueils ne surviennent, d'apporter un regard indépendant sur ce que vos données peuvent réellement démontrer, et de veiller à ce que l'analyse tienne face à un comité de lecture ou un comité R&D. Ce qui compte, c'est une conclusion solide, pas un volume de fichiers.
Comment nous aidons
Un seul interlocuteur sur l'ensemble du projet
De la première interrogation stratégique au résultat validé, nous intervenons là où vous avez besoin d'expertise, et seulement là.
La bonne stratégie
Nous identifions l'approche analytique et la technologie omique adaptées à votre question biologique ou à votre objectif R&D, afin que vous investissiez dans l'expérience qui peut réellement y répondre.
Un design solide
Analyse de puissance, réplicats, contrôles et gestion des effets batch anticipés avant la génération des données, pour éviter les erreurs qui rendent les résultats ininterprétables.
Audit & validation
Nous relisons de manière indépendante les analyses produites en interne ou par un tiers, pour vérifier, corriger, compléter et valider les résultats avant publication ou prise de décision.
Les bonnes personnes
Quand un projet dépasse le strict périmètre de la bioinformatique, nous vous orientons vers les partenaires et collaborateurs adaptés dans notre réseau, et coordonnons le volet analytique.
Où nous intervenons
En amont ou sur des analyses existantes
Deux modalités complémentaires, que la plupart de nos clients combinent naturellement au fil d'un même projet.
Avant de générer vos données
Réussir le design, du premier coup.
- Choisir la meilleure technologie pour votre question : RNA-seq bulk, scRNA-seq, spatial, génomique, épigénétique, multi-omique
- Analyse de puissance et estimation de la taille d'échantillon
- Randomisation, réplicats, contrôles et atténuation des effets de batch
- Structuration des métadonnées en vue de l'analyse, dans le respect des principes FAIR
- Un plan réaliste de coût, de faisabilité et de calendrier
Sur des analyses que vous avez déjà
Vous assurer que vos résultats tiennent.
- Audit indépendant d'analyses réalisées en interne ou par un tiers
- Reproduction et vérification des résultats clés lorsque les données le permettent
- Signalement des problèmes statistiques, méthodologiques ou d'interprétation
- Correction, complétion ou extension de l'analyse
- Une interprétation biologique solide, défendable devant un comité de lecture
Comment ça se passe
Une collaboration simple et transparente
Pas de long cycle d'achat. Nous convenons du périmètre et du prix avant tout démarrage.
Premier échange
Nous discutons de votre objectif, vos données et vos contraintes, sous NDA.
Périmètre & devis
Un plan clair, avec un forfait ou une estimation horaire, sous 48h.
Le travail
Conseil, analyse opérationnelle ou audit, avec des points réguliers.
Restitution
Des résultats documentés, reproductibles et une restitution claire que vous pouvez immédiatement exploiter.
Pourquoi travailler avec nous
Indépendants, rigoureux, et à l'aise avec votre biologie
Regard indépendant
Un avis extérieur, sans parti pris, épargné du biais de confirmation qui guette toute équipe analysant ses propres données.
La biologie d'abord
Nous parlons le langage de votre science : conseils et résultats sont formulés autour de votre question, pas seulement des statistiques.
Reproductible par défaut
Des workflows versionnés et documentés : chaque recommandation et chaque résultat peut être tracé et reproduit.
Rapide et senior
Vous échangez directement avec un bioinformaticien senior, réponse sous 48 heures, sans intermédiaire.
Modèles de collaboration
Au forfait ou au taux horaire, selon votre préférence
Nous recommandons le modèle le plus avantageux et le confirmons avant de démarrer. Sans surprise.
Projet au forfait
Idéal pour des livrables bien définis.
- Un tarif forfaitaire transparent convenu à l'avance
- Vous connaissez le coût total avant tout démarrage
- Périmètre, jalons et calendrier clairs
- Parfait pour une analyse ou un audit défini
Conseil au taux horaire
Idéal pour un accompagnement ouvert ou continu.
- Vous ne payez que le temps utilisé
- Une collaboration flexible et itérative
- Parfait pour la stratégie, l'exploratoire et les relectures
- Facile à intensifier ou réduire selon l'évolution du projet
Questions fréquentes
Que fait concrètement un consultant en bioinformatique ?
Nous aidons les équipes de recherche à prendre les bonnes décisions analytiques. Cela peut être : conseiller sur la meilleure technologie omique et la meilleure stratégie d'analyse pour votre question biologique avant de dépenser le moindre euro en séquençage, concevoir une expérience statistiquement solide, réaliser l'analyse nous-mêmes, ou auditer, valider, interpréter et compléter des analyses déjà réalisées. L'objectif est toujours le même : des résultats rigoureux, défendables et interprétables.
Pouvez-vous intervenir avant que nous générions des données ?
Oui, et c'est souvent là que le conseil apporte le plus de valeur. Nous vous aidons à choisir la bonne technologie (RNA-seq bulk, scRNA-seq, spatial, génomique, épigénétique, multi-omique), à dimensionner votre expérience avec une analyse de puissance, à planifier contrôles, réplicats et gestion des effets batch, et à structurer vos métadonnées pour faciliter l'analyse. Un protocole bien conçu en amont évite des problèmes coûteux et impossibles à corriger en aval.
Pouvez-vous relire ou valider une analyse déjà réalisée par quelqu'un d'autre ?
Oui. Nous auditons régulièrement des analyses existantes, qu'elles aient été produites en interne, par un ancien doctorant ou postdoc, ou par un autre prestataire. Nous vérifions la méthodologie, reproduisons les résultats clés lorsque c'est possible, signalons les problèmes statistiques ou d'interprétation, puis validons, corrigeons, complétons ou étendons le travail pour qu'il résiste à une relecture par les pairs ou à un comité R&D.
Réalisez-vous l'analyse vous-même ou conseillez-vous seulement ?
Les deux, selon votre besoin. Certains clients veulent un partenaire stratégique en amont et réalisent l'analyse avec leur propre équipe ; d'autres nous confient l'analyse complète. Nous nous adaptons à votre préférence et pouvons passer fluidement d'un rôle de conseil à un rôle opérationnel tout au long du projet.
Pouvez-vous nous mettre en relation avec des partenaires ou collaborateurs ?
Oui. Lorsqu'un projet nécessite une expertise ou des capacités au-delà de la bioinformatique, comme des prestataires de séquençage, des plateformes de paillasse ou des spécialistes du domaine, nous pouvons vous mettre en relation avec des partenaires et collaborateurs de confiance de notre réseau et coordonner le volet analytique.
Comment facturez-vous, au forfait ou au taux horaire ?
Selon ce qui vous convient. Pour les projets bien définis, nous proposons un forfait transparent convenu à l'avance, afin que vous connaissiez le coût total avant tout démarrage. Pour le conseil ouvert, les audits ou l'accompagnement continu, nous travaillons au taux horaire. Nous vous recommandons le modèle le plus avantageux pour votre situation et le confirmons avant de commencer.
Comment la confidentialité de mes recherches est-elle protégée ?
Nous signons un accord de confidentialité avant tout échange de données ou de résultats non publiés. Les données sont transférées via des canaux sécurisés et stockées sur des serveurs à accès restreint, et nous ne publions, partageons ni ne réutilisons jamais vos données sans votre consentement écrit explicite. Lorsque votre institution impose des exigences de sécurité spécifiques, notamment en milieu clinique, nous nous y conformons pleinement.
Que dois-je préparer avant de vous contacter ?
Une brève description de votre objectif de recherche, des données que vous avez déjà ou prévoyez de générer, des analyses ou décisions que vous envisagez, votre calendrier, et toute difficulté particulière que vous rencontrez. Avec cela, nous pouvons vous fournir une évaluation précise et une proposition sur mesure rapidement, généralement sous 48 heures.
Vous hésitez sur la marche à suivre pour votre projet omique ?
Présentez nous votre objectif et où vous en êtes dans le projet.
Échange confidentiel sous NDA. Réponse sous 48 heures.
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