Bioinformatique, biologie et recherche médicale : nos analyses et points de vue d'experts
Les batch effects en single-cell RNA-seq ne sont pas toujours corrigeables. Découvrez pourquoi le design expérimental prime sur les méthodes computationnelles comme Harmony, Seurat, scVI ou ComBat, et comment anticiper les situations irréversibles.
Quand l'intelligence artificielle rédige et évalue la littérature scientifique : enjeux éthiques, risques de biais et impact sur la rigueur de la recherche.
Du laboratoire de recherche au cabinet clinique : retour sur l'ascension du RNA-seq comme outil de diagnostic moléculaire et de médecine de précision.
Comment le séquençage haut débit et la bioinformatique permettent de détecter, tracer et anticiper l'émergence de nouveaux pathogènes viraux à l'échelle mondiale.
Un regard critique sur l'utilisation des modèles d'apprentissage automatique pour la classification moléculaire, la prédiction pronostique et la médecine de précision.
Juxtaposer génomique, transcriptomique et protéomique ne suffit pas : qu'est-ce qui distingue une vraie intégration multi-omique d'une simple combinaison d'analyses ?
Comment les technologies spatiales (Visium, MERFISH, Slide-seq) permettent de cartographier l'expression génique et de révéler l'architecture fonctionnelle des tissus.
Les domaines que nous explorons dans notre blog — et dans lesquels nous accompagnons nos clients au quotidien.
De la préparation des données au clustering : analyses scRNA-seq complètes et interprétables.
Visium, MERFISH, Slide-seq : résoudre la biologie dans son contexte tissulaire.
Machine learning, deep learning et modèles de fondation appliqués aux données omiques.
Caractérisation du microbiome et analyse de diversité par séquençage shotgun et 16S.
ATAC-seq, ChIP-seq, méthylation : décoder les mécanismes de régulation génique.
Nextflow, Snakemake, containers : industrialiser vos analyses pour des résultats fiables.
Notre équipe d'experts est disponible pour analyser vos données omiques et vous accompagner de l'analyse à la publication.
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